Le aree naturali protette con la loro bellezza, richezza e diversità rappresentano valore fondamentale e uno dei beni più significativi di Croazia. Croazia ha la posizione particolare geografica dove la pianura, montagna ed il litorale croato intrecciano diverse influenze climatiche e geografiche creando così numerosi paesaggi e le specie biologiche.
Grazie alla loro particolarità e valore, alcune aree sono iscritte alle liste dei territori del merito internazionale. Così Parco nazionale i Laghi di Plitvice è alla Lista dei beni culturali di UNESCO.
La lista delle riserve della biosfera, come parte della programma scientifica dell'UNESCO, “L'uomo e la bisofera”, include il Parco naturale Velebit su cui territorio sono anche i Parchi Nazionali Paklenica e Nord Velebit. Nel luglio/giugno 2012. è stata proclamata l'altra riserva della biosfera in Croazia – riserva d'oltreconfine della biosfera Mura-Drava-Dunav la quale è nota per la grande richezza e la diversità dei biotopi aquatici e zone umide e anche per la diversità delle specie animali e vegetali, specialmente pesci e ucelli.
I parchi naturali Kopacki rit e Lonjsko polje sono, insieme alla delta di Neretva e Crna Mlaka che è riserva ornitologica speciale, alla lista delle zone umide di valore internazionale secondo la Convezione di Ramsar. Allo stesso tempo, Kopacki rit, Lonjsko polje e Lago di Vrana, a causa della richezza del mondo degli uccelli, sono stati iscritti alla lista delle aree di valore orintologico d'Europa.